Patapon 2 to nietypowa, muzyczno-zręcznościowa gra akcji wymagająca od użytkownika poczucia rytmu. Gracz kieruje członkami plemienia Patapon, którzy zmuszeni są do walki o przetrwanie z wrogimi plemionami i rozmaitymi potworami. Stworki przypominają wyposażone w ręce i nogi oczy. Ich oddział uzbrojony w rozmaite rodzaje broni białej (miecze, topory, włócznie) i strzeleckiej (łuki, oszczepy) pod dowództwem niosącego sztandar wodza mają za zadanie przemierzać kolejne poziomy i likwidować napotkanych wrogów. Sterowanie w grze polega na takim wciskaniu przycisków konsoli by odegrana została jedna z kilku melodyjek, przekładających się na rozmaite komendy wydawane podopiecznym (przykładowo do przodu, zatrzymać się czy odwrót). Każdą melodyjkę można ponadto dodatkowo przedłużyć co zapewnia chwilowe zwiększenie możliwości Pataponów. Podczas rozgrywki gracz może zobaczyć w sumie prawie 50 rzadkich okazów Pataponów, około 500 przedmiotów i elementów uzbrojenia oraz ponad 80 rozbudowanych misji. W grze istnieje możliwość rozgrywek wieloosobowych przy pomocy łącza Wi-Fi. Grafika programu jest dwuwymiarowa.