Ninja Gaiden 3 to chronologicznie trzecia część popularnego cyklu gier akcji, w którym wcielając się w wojownika ninja eliminujemy dziesiątki napotykanych po drodze wrogów. W międzyczasie ukazało się jednak kilka innych poprawionych edycji oryginału, wobec czego seria tak naprawdę liczy sobie więcej pozycji. Ten tytuł jest bezpośrednią kontynuacją wydanego w 2008 roku Ninja Gaiden 2. Za jego powstanie ponownie odpowiada studio Team Ninja, choć tym razem już bez jednej z najbardziej kontrowersyjnych postaci w zespole – Tomonobu Itagakiego. Jeszcze raz przychodzi nam wcielić się w Ryu Hayabusę – ninję znanego między innymi z serii bijatyk Dead or Alive. W Ninja Gaiden 3 fabuła koncentruje się na utracie przez Ryu Hayabusę powierzonego jego opiece Smoczego Miecza i walce przeciw tajemniczej korporacji wykorzystującej kod genetyczny głównego bohatera do stworzenia niebezpiecznych monstrów.